生物工程系设立于2018年，开设有水产养殖技术、食品生物技术、药品生物技术、食品检验检测技术、食品营养与健康、食品智能加工技术、药品经营与管理、农产品加工与质量检测等共8个专业，在校生1500多人。拥有国家级骨干专业1个、省级双高专业群1个、省级特色专业1个、省级基层农技员定向培养专业2个。建设省级专业教学资源库2个、省级精品在线开放课程5门，省级一流专业核心课程1门。主持国家自然科学基金项目3项，省级科研项目30余项，公开发表SCI、核心期刊和省级期刊论文共80余篇，主编和参编教材30余本。

1、师资力量：拥有一支师德修养好、业务水平高、实践技能强的师资队伍，共有专兼职教师48人，其中教授2人，副教授10人, 讲师23人，博士3人，硕士30人，“双师素质”教师占专业课教师的80%以上。拥有省级教师教学创新团队1个，省级教学名师2人，江西省高校中青年骨干教师4人。教师荣获江西省科学技术进步一等奖1项、三等奖1项、农牧渔业技术改进二等奖1项、三等奖1项、江西省高等学校科研成果三等奖1项。教师在全国职业院校教学能力比赛中获二等奖2项，三等奖1项，省赛一等奖3项、二等奖1项。

2、实训基地：现有水产养殖技术（国家级生产性实训基地）、药品生物技术、农产品质量安全检测、食品生物技术及加工与检测四大类实训中心，专业实验实训室27个，实训仪器设备总值1600余万元，能充分满足学生实践性教学需要。与多家上市企业、全国农业产业化龙头企业合作，共建校外实训基地三十余个，实现校企资源共享、互惠双赢。

3、人才培养：高度重视学生身心发展和综合素质培养。近年来，荣获国家级各类比赛团体和个人一等奖6项，二等奖12项，三等奖5项，省级一等奖6项，二等奖14项，三等奖7项。同时，积极鼓励学生提升学历，学生专升本比例达25%，本科生考研录取率达13.3%毕业生专业知识扎实，实践能力强，深受用人单位欢迎，就业率连续多年达95%以上。

4、校企合作：推行“校企合作、工学结合”的人才培养模式，坚持产教研融合发展。与广东海大集团、江西兄弟药业有限公司、江西李渡酒业有限公司、厦门昶科生物科技有限公司、华测检测认证集团股份有限公司等30多家企事业单位建成为稳定的实习和就业基地。